巴哈伊信仰通过地方、国家和国际层面一系列选举产生的机构进行管理，没有神职阶层或教士群体。
世界正义院是巴哈伊信仰的国际管理机构，乃巴哈欧拉在其律法经典中钦定的最高行政管理机构，世界正义院每五年通过巴哈伊国际大会选举产生，由全球各国总灵理会（详见下文）成员担任代表参与选举。世界正义院于1963年首次选举产生，其永久所在地设于海法的卡尔迈勒山上。
各国巴哈伊社团的事务由总灵理会负责管理。这个由九人组成的理事会承担着指导、协调和推动全国地方灵理会及巴哈伊信徒活动的职责。总灵理会的具体职能包括：统筹管理社团财务资源、促进全国巴哈伊社团的发展与活力、监督社团事务（包括社会经济开发活动和资产）、处理与政府的关系、解答信徒和地方灵理会的疑问，以及加强巴哈伊社团参与国家层面的社会生活。
巴哈伊基层社团事务由地方灵理会管理。每个地方灵理会由每年选举产生的九名成员组成。与所有其他选举产生的巴哈伊机构一样，灵理会以集体形式运作，通过磋商做出决策。地方灵理会的职责包括：促进儿童和青少年灵性教育、加强巴哈伊社区生活的灵性和社会结构、评估和利用社区资源、确保社区成员的能量和才能有助于社区进步。
此外，巴哈伊信仰还设有顾问制度。这些顾问由世界正义院任命，任期五年，为全球各国及地区提供指导。目前共有90名顾问被派驻特定国家或地区，另有9名顾问组成海法巴哈伊世界中心的国际传导中心。
巴哈伊国际社团作为代表全球巴哈伊的非政府组织，自1948年起在联合国注册。该组织目前拥有联合国经济及社会理事会（ECOSOC）和联合国儿童基金会（UNICEF）的咨商地位，同时获得联合国环境规划署（UNEP）和联合国新闻部（DPI）的认证资格。巴哈伊国际社团与联合国及其专门机构、成员国、政府间组织、非政府组织、学术界及从业人员开展合作，并在亚的斯亚贝巴、布鲁塞尔、开罗、日内瓦、雅加达和纽约设有代表处。